De Gasthuiskerk is oorspronkelijk de kapel van het Sint Barbaragasthuis geweest. De geschiedenis van het gasthuis gaat terug tot het begin van de 14e eeuw. De oorspronkelijke kerk werd voor het eerst genoemd in de stadsrekeningen van 1396/1397. In 1936 werd de kerk gekocht door de in dat jaar geïnstitueerde Christelijke Gereformeerde Kerk. In 1954 en 1955 werd de kerk geheel gerestaureerd en in 1961 werden de gebouwen aan een zijde van de kerk gesloopt. De huidige consistorie was oorspronkelijk het koor van de kerk. Na vernieuwing van het liturgisch centrum in 1981, is in 1982 en 1983 het bijgebouw naast de kerk opgetrokken. In 2002 heeft de laatste verandering plaatsgehad waarbij de galerij werd vergroot, een middenpad werd aangelegd en het liturgisch centrum werd verhoogd.

De kerkdiensten zijn iedere zondag om 09.30 uur en om 16.30 uur.